Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CGGBP1Q9UFW8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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