Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM10Q9UDY6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM10Q9UDY6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms