Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNMT3BQ9UBC3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNMT3BQ9UBC3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNMT3BQ9UBC3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNMT3BQ9UBC3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms