Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FRMD4AQ9P2Q2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FRMD4AQ9P2Q2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMD4AQ9P2Q2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMD4AQ9P2Q2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms