Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTTNBP2NLQ9P2B4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTTNBP2NLQ9P2B4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms