Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1BQ9P298 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1BQ9P298 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms