Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCC2Q9P258 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCC2Q9P258 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms