Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SENP1Q9P0U3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SENP1Q9P0U3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SENP1Q9P0U3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms