Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKIPSDQ9NZQ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKIPSDQ9NZQ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms