Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT2Q9NZN8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT2Q9NZN8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms