Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD2L2Q9NZM6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKD2L2Q9NZM6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKD2L2Q9NZM6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms