Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDE1Q9NXR1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDE1Q9NXR1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDE1Q9NXR1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms