Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXD4L1Q9NU39 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXD4L1Q9NU39 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXD4L1Q9NU39 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms