Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDC42SE2Q9NRR3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDC42SE2Q9NRR3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms