Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRAC1Q9NRG0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRAC1Q9NRG0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRAC1Q9NRG0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRAC1Q9NRG0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRAC1Q9NRG0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRAC1Q9NRG0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRAC1Q9NRG0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRAC1Q9NRG0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRAC1Q9NRG0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRAC1Q9NRG0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRAC1Q9NRG0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRAC1Q9NRG0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms