Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR50

EIF2B3, Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF2B3Q9NR50 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF2B3Q9NR50 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF2B3Q9NR50 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF2B3Q9NR50 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms