Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSS2Q9NR19 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACSS2Q9NR19 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSS2Q9NR19 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms