Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM7Q9NQW5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM7Q9NQW5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM7Q9NQW5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms