Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CYLDQ9NQC7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYLDQ9NQC7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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