Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM4

EPB41L5, Band 4.1-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L5Q9HCM4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPB41L5Q9HCM4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB41L5Q9HCM4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41L5Q9HCM4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms