Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CLSPNQ9HAW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CLSPNQ9HAW4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CLSPNQ9HAW4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms