Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1BQ9H9Y6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR1BQ9H9Y6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms