Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETREG1Q9H6L5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RETREG1Q9H6L5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETREG1Q9H6L5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RETREG1Q9H6L5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms