Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIF1Q9H611 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIF1Q9H611 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms