Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC90BQ9GZT6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC90BQ9GZT6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC90BQ9GZT6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms