Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D2

CEP295, Centrosomal protein of 295 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295Q9C0D2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP295Q9C0D2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP295Q9C0D2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP295Q9C0D2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP295Q9C0D2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP295Q9C0D2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP295Q9C0D2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP295Q9C0D2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP295Q9C0D2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP295Q9C0D2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEP295Q9C0D2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
CEP295Q9C0D2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP295Q9C0D2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1732 ms