Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RSPO3Q9BXY4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms