Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAP1LC3CQ9BXW4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MAP1LC3CQ9BXW4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms