Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUSAP1Q9BXS6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUSAP1Q9BXS6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUSAP1Q9BXS6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms