Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLVAPQ9BX97 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLVAPQ9BX97 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLVAPQ9BX97 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLVAPQ9BX97 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLVAPQ9BX97 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLVAPQ9BX97 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLVAPQ9BX97 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLVAPQ9BX97 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLVAPQ9BX97 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PLVAPQ9BX97 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLVAPQ9BX97 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms