Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.32■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.29■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.29■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.27■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JAM3Q9BX67 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JAM3Q9BX67 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JAM3Q9BX67 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms