Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPATA9Q9BWV2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPATA9Q9BWV2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA9Q9BWV2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA9Q9BWV2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA9Q9BWV2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA9Q9BWV2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPATA9Q9BWV2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPATA9Q9BWV2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPATA9Q9BWV2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA9Q9BWV2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms