Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHID1Q9BWS9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHID1Q9BWS9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms