Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP58Q9BVL2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP58Q9BVL2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP58Q9BVL2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms