Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDHD3Q9BSH5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDHD3Q9BSH5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDHD3Q9BSH5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDHD3Q9BSH5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDHD3Q9BSH5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDHD3Q9BSH5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDHD3Q9BSH5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDHD3Q9BSH5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms