Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TXNDC17Q9BRA2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms