Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FERMT1Q9BQL6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FERMT1Q9BQL6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FERMT1Q9BQL6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FERMT1Q9BQL6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FERMT1Q9BQL6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FERMT1Q9BQL6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FERMT1Q9BQL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FERMT1Q9BQL6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FERMT1Q9BQL6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FERMT1Q9BQL6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FERMT1Q9BQL6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FERMT1Q9BQL6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms