Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC3Q9BQ90 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC3Q9BQ90 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC3Q9BQ90 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHDC3Q9BQ90 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHDC3Q9BQ90 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHDC3Q9BQ90 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHDC3Q9BQ90 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHDC3Q9BQ90 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHDC3Q9BQ90 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHDC3Q9BQ90 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHDC3Q9BQ90 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHDC3Q9BQ90 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHDC3Q9BQ90 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHDC3Q9BQ90 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHDC3Q9BQ90 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHDC3Q9BQ90 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHDC3Q9BQ90 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHDC3Q9BQ90 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHDC3Q9BQ90 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHDC3Q9BQ90 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms