Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NCAPGQ9BPX3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCAPGQ9BPX3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCAPGQ9BPX3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCAPGQ9BPX3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms