Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3GL2Q99962 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3GL2Q99962 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3GL2Q99962 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms