Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKP2Q99959 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP2Q99959 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms