Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC1Q99614 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC1Q99614 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC1Q99614 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC1Q99614 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1125.1 ms