Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LGMNQ99538 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LGMNQ99538 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGMNQ99538 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LGMNQ99538 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms