Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK15Q96Q40 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK15Q96Q40 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK15Q96Q40 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK15Q96Q40 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms