Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSPG4P5Q96PW8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSPG4P5Q96PW8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSPG4P5Q96PW8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms