Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCEEQ96PE7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCEEQ96PE7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCEEQ96PE7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCEEQ96PE7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms