Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU6

ZNF778, Zinc finger protein 778, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF778Q96MU6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF778Q96MU6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF778Q96MU6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF778Q96MU6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF778Q96MU6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF778Q96MU6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms