Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COX4I2Q96KJ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX4I2Q96KJ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX4I2Q96KJ9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX4I2Q96KJ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX4I2Q96KJ9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX4I2Q96KJ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms