Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPD52L3Q96J77 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPD52L3Q96J77 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPD52L3Q96J77 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms