Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITCHQ96J02 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITCHQ96J02 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITCHQ96J02 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms